マイクロアレイシーケンシングとは何ですか?
質問者:Winston Vagarshyan |最終更新日:2020年4月24日
カテゴリ:科学遺伝学
マイクロアレイは、数千の核酸が表面に結合し、ハイブリダイゼーションとそれに続くハイブリダイゼーションイベントの検出を介して混合物中の核酸配列の相対濃度を測定するために使用される技術です。
その中で、マイクロアレイはあなたに何を伝えますか?DNAマイクロアレイ(一般にDNAチップまたはバイオチップとしても知られています)は、固体表面に付着した微細なDNAスポットの集まりです。科学者は、DNAマイクロアレイを使用して、多数の遺伝子の発現レベルを同時に測定したり、ゲノムの複数の領域の遺伝子型を決定したりします。
さらに、マイクロアレイと次世代シーケンシングの違いは何ですか?マイクロアレイはハイブリダイゼーションに基づいていますが、次世代シーケンシングは合成、つまりDNAポリメラーゼによるヌクレオチドの取り込みに基づいています。次世代シーケンシングは、事前に選択されたターゲットに依存せずに、ゲノム全体またはトランスクリプトームを調べる場合に可能です。
このように、マイクロアレイはどのように機能しますか?
マイクロアレイの背後にある原理は、相補的な配列が互いに結合することです。未知のDNA分子は制限エンドヌクレアーゼによって断片に切断されます。これらのDNAフラグメントには蛍光マーカーが付いています。次に、これらをDNAチップのプローブと反応させます。
マイクロアレイが役立つのはなぜですか?
細胞には何千もの遺伝子が含まれていますが、すべての遺伝子が使用されているわけではなく、遺伝子のさまざまな組み合わせがさまざまな時期に使用されています。マイクロアレイにより、科学者はどの遺伝子がさまざまな細胞で使用されているかを調べることができます。
25の関連する質問の回答が見つかりました
マイクロアレイ技術のいくつかのアプリケーションは何ですか?
マイクロアレイアプリケーションの現在の範囲には、ハイブリダイゼーションによるシーケンシング、リシーケンシング、変異検出、遺伝子コピー数の評価、比較ゲノムハイブリダイゼーション、薬物発見、発現分析、およびイムノアッセイ(タンパク質マイクロアレイ)が含まれます。
染色体検査は何を示していますか?
染色体分析または核型分析は、異常を検出するために人の染色体の数と構造を評価する検査です。染色体は、各細胞核内の糸のような構造であり、体の遺伝的青写真を含んでいます。各染色体には、特定の場所に何千もの遺伝子が含まれています。
マイクロアレイの費用はいくらですか?
標的DNAマイクロアレイはサンプルあたり10ドルから100ドルで実行されますが、「ヒトゲノム全体は通常、サンプルあたり100ドルから1,000ドルです」とSchena氏は言います。 (NGSでは、全ゲノムシーケンスによって発生するコストを回避するためのターゲティング戦略も利用できますが、コストと時間の両方が追加されます。)
DNAマイクロアレイは癌の検出にどのように使用されていますか?
1990年代半ばに開発されて以来、 DNAマイクロアレイは癌との闘いにおける重要なツールになりました。たとえば、マイクロアレイは現在、遺伝子診断の重要なツールであり、医師は遺伝子発現の違いに基づいて、全体的な疾患カテゴリー内の特定のサブタイプを識別できます。
マイクロアレイは自閉症を検出できますか?
染色体マイクロアレイ分析は、自閉症スペクトラム障害の患者の染色体異常を検出する強力な能力があるため、自閉症スペクトラム障害の第一段階の遺伝子診断テストと見なす必要があります。
マイクロアレイテストはどのくらい正確ですか?
染色体マイクロアレイ分析は正確であることを証明します。彼は、この技術はすべての子供たちの問題を特定するのに役立つわけではないが、以前の染色体検査では検出されなかったさまざまな障害のある子供たちの異常を特定する可能性が5〜12パーセントあると述べた。
マイクロアレイを洗浄する必要があるのはなぜですか?
DNAマイクロアレイは、単一の反応で複数の遺伝子の発現を決定するために使用することができます。ハイブリダイゼーション後、マイクロアレイを洗浄して非特異的結合を排除し、スキャンして各スポットからの蛍光量を測定します。
マイクロアレイの制限は何ですか?
マイクロアレイ分析の限界。マイクロアレイ分析では、バランスの取れた転座(相互転座およびロバートソン転座)や逆位などの特定の染色体再配列は検出されません。これは、DNAの交換が行われたものの、マイクロアレイで検出可能なDNAの正味の増減がないためです。
mRNAは何でできていますか?
メッセンジャーRNA( mRNA )メッセンジャーRNA( mRNA )は、遺伝子のDNA鎖の1つに相補的な一本鎖RNA分子です。 mRNAは、細胞核を離れて細胞質に移動し、そこでタンパク質が作られる遺伝子のRNAバージョンです。
マイクロアレイの色はどういう意味ですか?
DNAがどのように結合するかに基づいて、レーザーでスキャンすると、各スポットは赤、緑、または黄色(赤と緑の組み合わせ)で表示されます。 •赤い斑点は、その遺伝子が癌細胞で強く発現していることを示しています。 (実験では、これらのスポットは濃いピンクになります。)
マイクロアレイを使用して病気を診断するにはどうすればよいですか?
診断DNAマイクロアレイは、遺伝子型決定および疾患を引き起こす疾患-relevant遺伝子または薬剤の決意、突然変異分析、単一ヌクレオチド多型(SNP)のスクリーニング、染色体異常の検出、および翻訳後修飾のグローバル決意するために使用されてきました。
RNAシーケンスがマイクロアレイよりも優れているのはなぜですか?
RNAによって生成されるデータの量-Seq実験は驚異的である可能性があります-マイクロアレイよりも桁違いに大きいです。 RNA - Seqは、発現が非常に低い遺伝子の検出においてより感度が高く、非常に豊富な遺伝子の発現の検出においてより正確です。 RNA - Seqはマイクロアレイよりも広いダイナミックレンジを持っています。
なぜcDNAが必要なのですか?
cDNAは、原核生物の真核生物遺伝子のクローンを作成するためによく使用されます。科学者が特定のタンパク質を通常は発現しない細胞で発現させたい場合(すなわち、異種発現)、そのタンパク質をコードするcDNAをレシピエント細胞に移します。
遺伝学の配列とは何ですか?
遺伝子アレイは、スポッティングまたは直接合成のいずれかによって、遺伝子特異的核酸のコレクションが定義された位置に配置された固体支持体です。 (文献では、「標的」という用語は、アレイに付着した核酸またはサンプルの標識された核酸のいずれかを指すことができる。
マイクロアレイは時代遅れですか?
マイクロアレイは約10年前に話題になりましたが、急速にシーケンス技術に取って代わられています。しかし、それは彼らがテーブルに何も残さないということではありません、実際、マイクロアレイはジェノタイピング関連の目的のための合理的な選択であり続け、それでも特定の利点を提供します。
次世代シーケンスとはどういう意味ですか?
次-世代シーケンシング(JEH-NEH-RAY-旬SEE-kwen-歌う)ハイスループット個体のゲノムのヌクレオチド配列の部分を決定するために使用される方法。この技術は、複数のDNA配列を並行して処理できるDNA配列決定技術を利用しています。