、チップ-seqとして知ら-sequencingチップは、DNAとタンパク質の相互作用を分析するために使用される方法です。 ChIP -seqは、クロマチン免疫沈降（ ChIP ）と超並列DNAシーケンスを組み合わせて、DNA関連タンパク質の結合部位を特定します。

また、ChIP seqはinvivoですか？ ChIP -超高スループット大規模並列シーケンシングとクロマチン免疫沈降（チップ）を組み合わせ配列は、ますますゲノム規模でのインビボマッピングタンパク質-DNA相互作用のために使用されています。通常、 ChIP - Seqからの短いシーケンス読み取りは、さらなる分析のためにリファレンスゲノムにマッピングされます。

したがって、ChIPデータとは何ですか？

クロマチン免疫沈降（ ChIP ）により、DNA上のタンパク質結合部位を決定することができます。クロマチンは、ヒストンタンパク質とともにヌクレオソームにパッケージ化されたDNAの複合体です。 ChIPは、細胞または組織のホルムアルデヒド固定によってDNAと関連タンパク質の間に作られた可逆的なクロスリンクを利用します。

ChIP seqデータをどのように分析しますか？

ChIP-seqデータの分析

1. 前処理シーケンス読み取り。
2. マップが読み取ります。
3. マップされたデータを後処理します。
4. ChIP信号の品質と強度を評価します。
5. ゲノムブラウザでカバレッジプロットを表示します。
6. MACS2でChIPピークを呼び出します。
7. 取得した呼び出しを検査します。
8. 呼び出されたピーク内の配列モチーフを探します。