BLASTアラインメントは、1つのシーケンスのすべての文字が、1つの文字または他の文字のギャップとペアになる、つまり「アラインされる」シーケンスのペアで構成されます。アラインメントスコアが文字の各整列ペアに値を代入した後、アラインメントの長さにわたって、これらの値を合計することによって計算されます。

また、シーケンスを整列させるとはどういう意味ですか？バイオインフォマティクスでは、配列アラインメントは、配列間の機能的構造、または進化的関係の結果であり得る類似の領域を同定するためのDNA、RNA、またはタンパク質の配列を配置する方法です。

ちょうどそう、良いビットスコアは何ですか？

ビットスコアは、相同性を推測するためのより良い経験則を提供します。平均的な長さのタンパク質の場合、ビットスコア50はほとんどの場合重要です。ビットスコア40は、7000エントリ未満のタンパク質データベースの検索でのみ重要です（E（）<0.001）。

なぜ配列アラインメントが重要なのですか？

生物学的配列のアラインメントは、おそらくバイオインフォマティクスの分野で最も重要であり、最も達成されています。彼らの最終的な目標は、異なる配列間の類似性を決定することです。機能予測：2つの遺伝子が類似しているかどうかを判断するための配列のアラインメント。